Однако к 2013 году СМИ сообщали о проблемах: часть объектов предприятия разрушалась на виду, другие превратились в долгострои из-за низкого качества работ, а некоторые сооружения не удалось вовремя ввести в эксплуатацию. По данным ИА PrimaMedia, процедура несостоятельности стартовала летом 2015 года. Спустя три года было введено внешнее управление, а в 2019-м началась конкурсная процедура. Организацию переименовали в ФГУП «ГВСУ №6» согласно распоряжению Министерства обороны. В рамках процесса управляющий реализовал активы общей стоимостью 14,6 миллиарда рублей. Особую роль сыграла продажа незавершенных строек на улице Бондаря, которые ушли за сумму свыше миллиарда рублей. С долговой задолженностью предприятия удалось взыскать 2 миллиарда рублей, еще 1,3 миллиарда поступило от текущей деятельности. Все кредиторы первой очереди получили 100% причитающихся средств. Заимодавцы второй и третьей очередей добились полного погашения обязательств. Четвертая очередь смогла получить лишь 24,6% от своих требований на сумму 38,9 миллиарда рублей. Из-за недостатка активов для полного расчета с кредиторами суд завершил конкурсное производство. Арбитражный суд Хабаровского края признал полный объем работы управляющего, касающийся формирования конкурсной массы и выполнения обязательств перед заимодавцами. Предприятие исключают из Единого государственного реестра юридических лиц.